Der Reformvertrag von Lissabon soll alles einfacher machen, allerdings sind auch die dort niedergeschriebenen Entscheidungsmechanismen noch immer reichlich kompliziert. Grundsätzlich gelten Mehrheitsentscheidungen nun in fast allen  Politikbereichen ausgeweitet. Damit soll verhindert werden, dass einzelne Mitgliedsstaaten Beschlüsse blockieren.

Deshalb wurde das Prinzip der doppelten Mehrheit eingeführt: Eine Entscheidung im Ministerrat ist dann gefallen, wenn mindestens 55 Prozent der Mitgliedsstaaten dafür sind, die zugleich 65 Prozent der Bevölkerung repräsentieren. In sensiblen Fragen müssen es sogar 72 Prozent der Staaten und 65 Prozent der Bevölkerung sein. Eine Sperrminorität muss mindestens aus vier Staaten bestehen. Ausserdem gibt es in gewissen Politikbereichen, beispielsweise im Steuerrecht, weiterhin ein Vetorecht.

Bislang fielen Entscheidungen im Rat in drei verschiedenen Verfahren. In besonders sensiblen Politikbereichen mussten sie sogar einstimmig sein. Für die weitaus meisten Fragen genügte  eine qualifizierte Mehrheit. In wenigen Ausnahmefällen reichte auch ein einfaches Mehr.

Kompliziert wurde es erst in umstrittenen Fällen. Dann konnte es dazu kommen, dass eine dreifache Mehrheit nötig wurde. Neben einer qualifizierten Mehrheit im Rat musste dann eine Mehrheit der Mitgliedsstaaten und, auf Antrag eines Mitgliedsstaates, mindestens 62 Prozent der EU-Bevölkerung erreicht werden. Der Vorsitz im Rat wechselte halbjährlich nach einem komplizierten Rotationsverfahren, das sowohl das Alphabet als auch auch die Grösse des Landes berücksichtigte.